من ضمن نشاط قسم المياه والأودية في الوزارة لحماية البيئة حول إعادة إصلاح الأودية القيام برقابة مكثفة لمياه الأودية. ويقوم خبراء الوزارة بجمع عينات من مياه الأودية ومصادر التلويث وبفحصها علميا.

وتجمع الوزارة المعطيات في قاعدة معطيات متعددة السنوات من أجل مراقبة ظروف التلوث والنظافة في الأودية.

تتنشر الوزارة كل عام نوعين من التقارير العلمية:

• تقرير رقابة جودة المياه في الأودية, في أحواض المياه المطهرة وفي المنشآت لتنقية مياه المجاري الصحية. يشمل هذا التقرير المعطيات حول المواد الملوثة لمياه الأودية. يكتب هذا التقرير خبراء قسم رقابة البيئة في سلطة الطبيعة والحدائق التي تعتبر خاضعة للوزارة لحماية البيئة.

• تقرير حجم الملوثات في الأودية. يشمل التقرير على كمية المواد الملوثة التي يتم تصريفها في الأودية من مختلف مصادر التلويث. يكتب التقرير خبراء جناح المياه والأودية في الوزارة لحماية البيئة.

•   تقارير رقابة المجاري المطهرة في الأودية (باللغة العبرية)